Non solo programmi rilasciata sotto la licenza GPL per Internet, Office, Sicurezza, Grafica, Multimedia oppure il divertimento offre la nuova versione di Ubuntu 10.04 Lucid Lynx, ma anche tantissimi programmi, alcuni noti, come Kalign, Mpqc, Kstars, Montecarlo ed altri un po' meno, ma comunque sempre validissimi dedicati alla scienza.A continuazione l'elenco completo K-M con la solita recensione individuale e i collegamenti all'Home Page ufficiale, guide, tutorials e recensioni:
- Kalign allineamento di sequenza multiple globale e progressivo.
- Kalign è uno strumento a riga di comando per fare allineamenti multipli di sequenze biologiche. Usa l'algoritmo per corrispondenze di stringhe Wu-Manber per migliorare sia l'accuratezza che la velocità dell'allineamento.
- Usa un approcco globale, progressivo per l'allineamento, arricchito dall'uso di un algoritmo per corrispondenze approssimate di stringhe per calcolare le distanze tra le sequenze e incorporando corripondenze locali nell'allineamento globale.
- In comparazioni fatte dai suoi stessi autori, Kalign era circa 10 volte più veloce di ClustalW e, a seconda della dimensione dell'allineamento, fino a 50 volte più veloce dei metodi iterativi popolari.
- Kalzium è un software libero che consente la visualizzazione della tavola periodica degli elementi.
Kalzium è un programma per la visualizzazione della tavola periodica degli elementi per l'ambiente desktop KDE.
Il programma contiene informazione sugli elementi chimici, incluso la massa, carica, foto, informazioni sulla scoperta, dati sulla chimica e sull'energia, e un modello dell'atomo.
La tabella può essere configurata per mostrare la numerazione, la fase, e il colore degli elementi in vari modi.
È possibile colorare la tabella stessa in base a varie proprietà chimiche, ad esempio per blocchi o secondo la famiglia di ogni elemento, oppure colorando gli elementi con un gradiente di colore rosso a seconda di una proprietà come il punto di ebollizione o il raggio atomico. Inoltre è disponibile un indice per date che consente di mostrare solo gli elementi scoperti fino a una data specifica.
KStars planetario digitale per KDE capace di fornire un'accurata simulazione del cielo notturno, con stelle, costellazioni e galassie.
KStars è un programma di simulazione astronomica incluso nel pacchetto kdeedu di KDE. È un software libero distribuito con licenza GNU General Public License.
KStars fa parte del modulo kdeedu (programmi di edutainment) di KDE, e viene normalmente rilasciato assieme agli altri programmi.
E' un planetario digitale per KDE (K Desktop Environment) capace di fornire un'accurata simulazione del cielo notturno, con stelle, costellazioni, ammassi, nebulose, galassie, tutti i pianeti, il Sole, la Luna, comete e asteroidi. Si può vedere il cielo come appare da qualsiasi località terrestre, in qualsiasi data.
- kxterm (2006.dfsg.2-14ubuntu2) [universe]
- CERNLIB data analysis suite - KUIP terminal emulator
- last-align (87-1) [universe]
- genome-scale comparison of biological sequences
- libball1.3 (1.3.2-2) [universe]
- Biochemical Algorithms Library
- libballview1.3 (1.3.2-2) [universe]
- Biochemical Algorithms Library, VIEW framework
- libbio-ruby (1.4.0-2) [universe]
- bioruby tools for computational molecular biology
- libbio-ruby1.8 (1.4.0-2) [universe]
- bioruby tools for computational molecular biology
- libbiojava-java (1:1.7.1-1) [universe]
- Java API to biological data and applications
- libbiojava-java-demos (1:1.7.1-1) [universe]
- Example programs for BioJava
- libbiojava1.7-java (1:1.7.1-1) [universe]
- Java API to biological data and applications
- libgeotiff-epsg (1.2.5-1) [multiverse]
- the GeoTIFF library -- EPSG Geodetic Parameter Dataset
- libghemical-data (2.98-2) [universe]
- Molecular Modelling Library (data files)
- libgpib-bin (3.2.11-0.2ubuntu4) [universe]
- libgpib support applications and configuration
- libgrib-api-data (1.8.0.1-1) [universe]
- grib_api definition files
- liblas-bin (1.2.1-1) [universe]
- ASPRS LiDAR data translation toolset
- libnecpp-dev (1.3.0+cvs20090101-1ubuntu2) [universe]
- development files for libnecpp
- libnecpp0 (1.3.0+cvs20090101-1ubuntu2) [universe]
- library to use NEC2++
- libstxxl1 (1.2.1-2) [universe]
- C++ STL drop-in replacement for extremely large datasets
- libworldwind-java (0.5.0-7) [multiverse]
- 3D Virtual Globe
- lipsia (1.6.0-3) [universe]
- analysis suite for MRI and fMRI data
- loki (2.4.7.4-4) [universe]
- MCMC linkage analysis on general pedigrees
- loki-doc (2.4.7.4-4) [universe]
- Postscript manual for loki
- lutefisk (1.0.5a.cleaned-1) [universe]
- de novo interpretation of peptide CID spectra
- mafft (6.717-1) [universe]
- Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
- maq (0.7.1-3) [universe]
- maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences
- massxpert (2.1.1-1) [universe]
- linear polymer mass spectrometry software
- massxpert-data (2.1.1-1) [universe]
- linear polymer mass spectrometry software - arch-indep data
- mayavi2 (3.3.0-1) [universe]
- A scientific visualization package for 2-D and 3-D data
- meep (1.1.1-3build1) [universe]
- software package for FDTD simulation
- meep-mpi (1.1.1-3build1) [universe]
- software package for FDTD simulation, parallel (mpich) version
- melting (4.3c-1) [universe]
- compute the melting temperature of nucleic acid duplex
- melting-gui (4.3c-1) [universe]
- graphical interface to compute the melting temperature of nucleic acid duplex
- merkaartor (0.14+svnfixes~20090912-2build1) [universe]
- map editor for OpenStreetMap.org
- mgltools-geomutils (1.5.4.cvs.20090603-1) [multiverse]
- Python library for geometric analyses
- mgltools-pyautodock (1.5.4.cvs.20090603-1) [multiverse]
- Python implementation of autodock
- mgltools-scenario (1.5.4.cvs.20090514-1) [multiverse]
- Python-based viewer of molecular structures
- mgltools-symserv (1.5.4.cvs.20090603-1) [multiverse]
- Symetry server
- mgltools-utpackages (1.5.4.cvs.20090603-1) [multiverse]
- UT Austin software Python extensions
- mgltools-vision (1.5.4.cvs.20090603-1ubuntu1) [multiverse]
- Python-based Visual Programming Environment
- minc-tools (2.0.18-1build1) [universe]
- MNI medical image format tools
- minisat2 (070721-8) [universe]
- Fast and lightweight SAT solver
- mipe (1.1-3) [universe]
- Tools to store PCR-derived data
- mitools (1.8.1-1) [universe]
- view, convert and perform basic maths with medical image datasets
- mmass (2.4.0-4) [universe]
- Mass spectrometry tool for proteomics
- mn-fit (5.13-7) [universe]
- interactive analysis package for fitting data and histograms
- mn-fit-common (5.13-7) [universe]
- common files for Mn_Fit
- molphy (2.3b3-5) [multiverse]
- Program Package for MOLecular PHYlogenetics
- montecarlo-base (2006.dfsg.2-5ubuntu3) [universe]
- [Physics] Common files for CERNLIB Monte Carlo libraries
- montecarlo-data (2006.dfsg.2-5ubuntu3) [universe]
- [Physics] data for CERNLIB Monte Carlo libraries
- mopac7-bin (1.14-4) [universe]
- Semi-empirical Quantum Chemistry Library (binaries)
- mpb (1.4.2-14build1) [universe]
- MIT Photonic-Bands
- mpb-mpi (1.4.2-14build1) [universe]
- MIT Photonic-Bands, parallel (mpich) version
- mpqc (2.3.1-4) [universe]
- The Massively Parallel Quantum Chemistry Program
- mpqc-support (2.3.1-4) [universe]
- Support programs and tools for MPQC
- mrpt-apps (0.8.1svn1408-1) [universe]
- Mobile Robot Programming Toolkit - Console and GUI applications
- mrpt-libs (0.8.1svn1408-1) [universe]
- Mobile Robot Programming Toolkit - All the libraries
- Mssstest rileva la velocità di progressione della malattia delle persone con sclerosi multipla (SM).
- Supponiamo che uno è interessato a determinare se il genotipo in qualche luogo di interesse influenza la velocità di progressione della malattia delle persone con sclerosi multipla (SM).
- Un metodo sarebbe quello di calcolare il punteggio EDSS medio in pazienti con ciascuno dei genotipi e verificare se esse sono significativamente diverse.
- Tuttavia, questo approccio è inefficiente se i pazienti hanno il loro EDSS valutati a diversa durata della malattia, per pazienti che hanno avuto più di MS hanno in genere più elevati punteggi EDSS indipendentemente dal loro genotipo.
- Regolando per durata, un test più potente può essere sviluppato.
- Scheda completa e istruzioni per il download
- mummer (3.22~dfsg-2) [universe]
- Efficient sequence alignment of full genomes
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